生物信息學(xué)研究員/高級(jí)研究員
15000-20000元
上海
3年以上
碩士
上海
3年以上
碩士
- 全勤獎(jiǎng)
- 節(jié)日福利
- 不加班
- 周末雙休
職位描述
該職位還未進(jìn)行加V認(rèn)證,請(qǐng)仔細(xì)了解后再進(jìn)行投遞!
崗位職責(zé):
1、基于AI預(yù)測(cè)模型(如AlphaFold-Drug)優(yōu)化可切割/不可切割連接子結(jié)構(gòu),建立payload(微管抑制劑、DNA損傷劑等)的毒性-穩(wěn)定性量化評(píng)估體系;
2、通過(guò)結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)(Rosetta、HADDOCK)設(shè)計(jì)抗體突變體,提升親和力、降低免疫原性;建立抗體-FcγR相互作用預(yù)測(cè)流程,優(yōu)化ADCC/CDC效應(yīng);
3、應(yīng)用深度學(xué)習(xí)(Epitope3D、BepiPred-3.0)解析靶點(diǎn)-抗體結(jié)合界面,指導(dǎo)表位定向改造;開(kāi)發(fā)多物種交叉反應(yīng)性評(píng)估模型,降低臨床前物種差異風(fēng)險(xiǎn);
4、主導(dǎo)單細(xì)胞測(cè)序(10x Genomics、Nanostring)數(shù)據(jù)分析,識(shí)別預(yù)測(cè)ADC療效的腫瘤微環(huán)境特征;構(gòu)建基于WES/RNA-seq的耐藥性標(biāo)志物篩查流程;
5、整合TCGA、DepMap等數(shù)據(jù)庫(kù),建立靶點(diǎn)"可藥性-腫瘤特異性-臨床關(guān)聯(lián)性"三維評(píng)估模型;開(kāi)發(fā)跨膜蛋白的胞外域結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具;
6、負(fù)責(zé)多組學(xué)數(shù)據(jù)(如基因組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組、蛋白質(zhì)組等)的深度挖掘與分析;根據(jù)項(xiàng)目需要制定項(xiàng)目方案、編寫(xiě)生信分析代碼、程序測(cè)試,負(fù)責(zé)撰寫(xiě)相關(guān)軟件文檔。
崗位要求:
1、生物信息學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、人工智能或相關(guān)專業(yè)碩士及以上學(xué)歷,3年以上相關(guān)工作經(jīng)驗(yàn);
2、熟練使用Linux系統(tǒng),至少精通兩門編程語(yǔ)言(Python/R/Perl),具備生物信息學(xué)算法開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn);熟練掌握抗體藥物或抗體蛋白的相關(guān)數(shù)據(jù)特點(diǎn)和分析流程,能運(yùn)用相關(guān)工具如BWA、GATK、STAR等進(jìn)行數(shù)據(jù)處理;
3、有ADC藥物開(kāi)發(fā)實(shí)際項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先,包括抗體篩選、linker設(shè)計(jì)、payload優(yōu)化、抗體工程改造、酶的定向進(jìn)化等方面的生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn);
4、良好的團(tuán)隊(duì)合作和跨部門溝通能力,與實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)緊密合作,準(zhǔn)確解讀分析結(jié)果,為藥物研發(fā)提供有力的數(shù)據(jù)支持;能夠與實(shí)驗(yàn)科學(xué)家、藥物化學(xué)家、臨床醫(yī)生等多學(xué)科團(tuán)隊(duì)成員有效溝通和合作;
5、有良好的統(tǒng)計(jì)分析能力;
6、具備良好的英語(yǔ)讀寫(xiě)能力,能夠閱讀和理解英文文獻(xiàn)、法規(guī)文件等資料、撰寫(xiě)英文報(bào)告等。
1、基于AI預(yù)測(cè)模型(如AlphaFold-Drug)優(yōu)化可切割/不可切割連接子結(jié)構(gòu),建立payload(微管抑制劑、DNA損傷劑等)的毒性-穩(wěn)定性量化評(píng)估體系;
2、通過(guò)結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)(Rosetta、HADDOCK)設(shè)計(jì)抗體突變體,提升親和力、降低免疫原性;建立抗體-FcγR相互作用預(yù)測(cè)流程,優(yōu)化ADCC/CDC效應(yīng);
3、應(yīng)用深度學(xué)習(xí)(Epitope3D、BepiPred-3.0)解析靶點(diǎn)-抗體結(jié)合界面,指導(dǎo)表位定向改造;開(kāi)發(fā)多物種交叉反應(yīng)性評(píng)估模型,降低臨床前物種差異風(fēng)險(xiǎn);
4、主導(dǎo)單細(xì)胞測(cè)序(10x Genomics、Nanostring)數(shù)據(jù)分析,識(shí)別預(yù)測(cè)ADC療效的腫瘤微環(huán)境特征;構(gòu)建基于WES/RNA-seq的耐藥性標(biāo)志物篩查流程;
5、整合TCGA、DepMap等數(shù)據(jù)庫(kù),建立靶點(diǎn)"可藥性-腫瘤特異性-臨床關(guān)聯(lián)性"三維評(píng)估模型;開(kāi)發(fā)跨膜蛋白的胞外域結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)工具;
6、負(fù)責(zé)多組學(xué)數(shù)據(jù)(如基因組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組、蛋白質(zhì)組等)的深度挖掘與分析;根據(jù)項(xiàng)目需要制定項(xiàng)目方案、編寫(xiě)生信分析代碼、程序測(cè)試,負(fù)責(zé)撰寫(xiě)相關(guān)軟件文檔。
崗位要求:
1、生物信息學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、生物學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、人工智能或相關(guān)專業(yè)碩士及以上學(xué)歷,3年以上相關(guān)工作經(jīng)驗(yàn);
2、熟練使用Linux系統(tǒng),至少精通兩門編程語(yǔ)言(Python/R/Perl),具備生物信息學(xué)算法開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn);熟練掌握抗體藥物或抗體蛋白的相關(guān)數(shù)據(jù)特點(diǎn)和分析流程,能運(yùn)用相關(guān)工具如BWA、GATK、STAR等進(jìn)行數(shù)據(jù)處理;
3、有ADC藥物開(kāi)發(fā)實(shí)際項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)者優(yōu)先,包括抗體篩選、linker設(shè)計(jì)、payload優(yōu)化、抗體工程改造、酶的定向進(jìn)化等方面的生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn);
4、良好的團(tuán)隊(duì)合作和跨部門溝通能力,與實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)緊密合作,準(zhǔn)確解讀分析結(jié)果,為藥物研發(fā)提供有力的數(shù)據(jù)支持;能夠與實(shí)驗(yàn)科學(xué)家、藥物化學(xué)家、臨床醫(yī)生等多學(xué)科團(tuán)隊(duì)成員有效溝通和合作;
5、有良好的統(tǒng)計(jì)分析能力;
6、具備良好的英語(yǔ)讀寫(xiě)能力,能夠閱讀和理解英文文獻(xiàn)、法規(guī)文件等資料、撰寫(xiě)英文報(bào)告等。
工作地點(diǎn)
地址:上海浦東新區(qū)哈雷路998號(hào)4號(hào)樓
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